Nella Villa Comunale si trova anche la Stazione Zoologica, fondata nel 1872 dallo studioso naturalista tedesco Anton Dohrn, che ne face anche un punto d'incontro di intellettuali ed artisti. Essa ospita il più antico aquarium d'Europa, destinato allo studio esclusivo delle specie ittiche presenti nel Golfo di Napoli. L'Acquario si trova al terzo piano ed è aperto alle visite del pubblico.

Al centro della Villa si trova la grande Cassa Armonica tutta in ghisa e vetro, costruita nel 1877 in base al progetto di Alvino. Per molti anni questa struttura è stata centro di ritrovo e di divertimento delle serate mondane estive della borghesia napoletana: in essa si situava l'orchestrina e tutt'attorno prendevano posto gli spettatori a godersi la musica e ad intrattenersi in società.

Dietro la Villa Comunale corre la Riviera di Chiaia, il cui palazzo più rappresentativo è la Villa Pignatelli, oggi sede del Museo Principe Diego Aragona Pignatelli Cortes, dopo la donazione fattane allo Stato italiano nel 1952 dalla principessa Rosina Pignatelli di Monteleone. Preceduta da uno splendido giardino, presenta una esposizione permanente di arredi e quadri ottocenteschi, nonché uno spazio destinato alle mostre itineranti. Vi si svolgono anche concerti di musica da camera.